Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBP2P32456 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms