Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCND2P30279 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCND2P30279 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms