Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms