Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms