Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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