Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BGNP21810 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BGNP21810 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BGNP21810 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BGNP21810 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BGNP21810 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BGNP21810 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms