Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms