Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms