Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOT1P17174 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms