Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEFHP12036 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEFHP12036 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 365.3 ms