Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms