Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms