Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBP07199 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms