Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TYMSP04818 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TYMSP04818 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms