Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGFRP00533 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGFRP00533 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms