Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.1 ms