Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COCHO43405 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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