Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A2O14975 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms