Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
B4DXG7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
B4DXG7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
B4DXG7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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