Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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