Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms