Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1P1A8MUH7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms