Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 732.8 ms