Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB15A6NHN6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms