Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms