Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms