Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX13Q9Y5W8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNX13Q9Y5W8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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