Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms