Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms