Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
L1RE1Q9UN81 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms