Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms