Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms