Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms