Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GULP1Q9UBP9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GULP1Q9UBP9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GULP1Q9UBP9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms