Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms