Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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