Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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