Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms