Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms