Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms