Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms