Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms