Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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