Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPR78Q96P69 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms