Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms