Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINGO1Q96FE5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms