Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms