Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms