Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms