Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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GTF3C6Q969F1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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GTF3C6Q969F1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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GTF3C6Q969F1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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